Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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AtmQ62388 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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