Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sycp1Q62209 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sycp1Q62209 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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