Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms