Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf3Q60765 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms