Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnk2a1Q60737 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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