Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms