Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms