Protein–RNA interactions for Protein: Q571G4

Lin54, Protein lin-54 homolog, mousemouse

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin54Q571G4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lin54Q571G4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lin54Q571G4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lin54Q571G4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Lin54Q571G4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lin54Q571G4 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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