Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbm44Q3V089 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rbm44Q3V089 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbm44Q3V089 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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