Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6899Q3USS0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms