Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms