Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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