Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms