Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms