Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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