Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kdm4dQ3U2K5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms