Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LcorlQ3U285 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms