Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 2610017A05Rik-201ENSMUST00000204670 1661 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd33bQ3U0L2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms