Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ctdnep1Q3TP92 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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