Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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