Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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