Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms