Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VgfQ0VGU4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VgfQ0VGU4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms