Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms