Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms