Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SctQ08535 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SctQ08535 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SctQ08535 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms