Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms