Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms