Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnb1Q03717 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnb1Q03717 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnb1Q03717 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnb1Q03717 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kcnb1Q03717 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnb1Q03717 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnb1Q03717 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kcnb1Q03717 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnb1Q03717 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnb1Q03717 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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