Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GscQ02591 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GscQ02591 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms