Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms