Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms