Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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