Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RhodP97348 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RhodP97348 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RhodP97348 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms