Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms