Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irx2P81066 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Irx2P81066 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx2P81066 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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