Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms