Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Taf13P61216 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf13P61216 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms