Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sh3bp1P55194 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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