Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SftpbP50405 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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