Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbrP50284 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LtbrP50284 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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LtbrP50284 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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LtbrP50284 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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LtbrP50284 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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