Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms