Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms