Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms