Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TesP47226 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TesP47226 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms