Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms