Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbP41155 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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LtbP41155 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbP41155 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms