Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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