Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VhlP40338 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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VhlP40338 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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VhlP40338 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VhlP40338 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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VhlP40338 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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VhlP40338 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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VhlP40338 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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VhlP40338 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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