Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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PpargP37238 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PpargP37238 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PpargP37238 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PpargP37238 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PpargP37238 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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